Piąte piętro zajmowały w czasach Komitetu Wojewódzkiego PZPR pomieszczenia Wojewódzkiej Komisji Kontroli Partyjnej oraz pokoje gościnne, udostępniane na potrzeby delegatów z innych regionów bądź centrali. Po 1990 roku mieściły się tu pokoje Instytutu Archeologii (Prahistorii) UAM.
O tym jak funkcjonował przez lata gmach Collegium Martineum można dowiedzieć się z publikacji „Collegium Martineum. Biografia Miejsca”.